凌云寺是由天王殿、大雄殿 、藏經樓組成的三重四合院建筑，丹墻碧瓦，綠樹掩映。
天王殿前是參天古木楠樹，殿外兩側分列著四座明清兩代重修寺字的碑記。殿內正中塑像為彌勒坐像，皤腹歡顏，俗稱“大肚羅漢”。兩旁分列四大天王塑像，攢眉怒目，威武雄壯。天王殿后為韋馱殿，供奉木雕裝金的護法神韋馱。
穿過天王殿，為明代建筑大雄寶殿，是僧眾舉行宗教活動的主要場所。殿內正中端坐釋迦牟尼三身像（法身、 應身、報身），造型優美，神態莊重。兩旁分列十八羅漢，神形各異，栩栩如生。大雄寶殿背面是新塑的凈瓶觀音，兩邊分列文殊、普賢、地藏和大勢至四菩薩像，是明代以前的作品。
寺內最后一重殿是藏經樓，原為寺內收藏佛教經卷的地方，于1930年新建。從它的結構和外形可以看到近代建筑風格，在寺字中別具一格卻另有一番情趣。樓下新辟“海師堂”，塑有大佛建造者海通法師、章仇兼瓊、韋皋的全身像，以此寄托后人對他們的敬仰之情。
